Molecular cloning, expression analysis and enzymatic characterization of cathepsin K from olive flounder (Paralichthys olivaceus)
- Alternative Title
- 넙치 카텝신 K의 클로닝, 발현 및 효소특성 분석
- Abstract
- Papain family중 하나인 cysteine proteases는 근골격계 질환 치료를 위한 target molecule로 인식되어 왔고, 그 중 세포 외 기질 단백질인 collagen을 분해할 수 있는 cathepsin S와 K에 많은 연구가 집중되고 있다. 파골 세포에서 발현되는 cathepsin K는 골 흡수 억제제 개발을 위한 주요 타겟으로써 연구가 진행되고 있다. 이 연구에서는 넙치 cathepsin K 유전자의 발현 양상과 넙치 cathepsin K(PoCtK)의 클로닝, 발현 및 효소특성을 분석하였다. 넙치의 cathepsin K 유전자를 정상조직과 LPS 자극을 한 조직에서의 발현 양상을 분석한 결과 근육에 LPS를 자극 후 6시간째에 발현량이 눈에 띄게 증가하였다. Cathepsin K 유전자를 클로닝 및 서열화 하였으며, 재조합 단백질을 발현시켜 그 특성을 분석하였다. 재조합 된 cathepsin K 단백질은 pGEX-4T-1 벡터를 사용하여 E. Coli DH5αMCR 균주에서 발현되었으며, soluble한 cathepsin K는 GST fusion protein으로 50kDa으로 정제되었으며, 이 단백질은 gelatin 분해능을 보였으며, chondroitin 4-sulfate와 complex를 이루어 collagen type Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ,Ⅵ와 넙치 근육으로부터 분리한 acid soluble collagen을 분해하였다. 최적 pH인 8.0에서 Synthetic Fluorogenic Substrate인 Z-GPR-AMC을 분해함을 이용하여 저해제와 보조인자 효과를 알아본 결과, 일반적으로 알려진 E-64에는 농도의존적으로 저해되었고, Antipain과 leupeptin에 거의 완벽하게 저해되었다. 보조인자 시험에서는 칼슘이온의 효과가 가장 컸다. 이 결과들로부터 PoCtK는 포유류의 cathepsin K와 기능적으로 유사함을 알 수 있었고, 이를 이용하여 어류의 근육 염증 및 궤양, 뼈 변형 등의 질병 연구에 중요한 정보를 제공할 것으로 생각된다.
In this study, we assessed the putative physiological roles of cathepsin K from the muscles of a flatfish, the olive flounder. This is the first report addressing enzymatic characterization in fish. In this study, we have cloned a cDNA encoding for cathepsin K (PoCtK), a cysteine protease of the papain family from the olive flounder, Paralichthys olivaceus. The tissue-specific expression pattern of PoCtK, determined via RT-PCR analysis, revealed ubiquitous expression in normal and bacterial lipopolysaccharide (LPS)-stimulated tissues with high levels of expression in the heart, kidney, spleen, gill, and bone marrow. However, IL-1β and PoCtK expressions were shown to be significantly increased in muscle only at 6h post-injection with LPS. The cDNA encoding for the mature enzyme of PoCtK was expressed in Escherichia coli using the pGEX-4T-1 expression vector system. Its activity was quantified via the cleavage of the synthetic peptide Z-Gly-Pro-Arg-AMC, zymography, and the collagen degradation assay. The optimum pH for the protease activity was 8, and the recombinant PoCtK enzyme degraded collagen types I, II, III, IV, and VI and acid-soluble collagen from olive flounder muscle in the presence of chondroitin 4-sulphate (C-4S).
- Author(s)
- 제주은
- Issued Date
- 2009
- Awarded Date
- 2009. 2
- Type
- Dissertation
- Keyword
- Cathepsin K cDNA cloning Collagenase Cysteine protease Lipopolysaccharide Olive flounder (Paralichthys olivaceus)
- Publisher
- 부경대학교 대학원
- URI
- https://repository.pknu.ac.kr:8443/handle/2021.oak/10582
http://pknu.dcollection.net/jsp/common/DcLoOrgPer.jsp?sItemId=000001954721
- Alternative Author(s)
- Je, Ju Eun
- Affiliation
- 부경대학교 대학원
- Department
- 대학원 수산생명의학과
- Advisor
- 정준기
- Table Of Contents
- 1. Introduction = 1
2. Materials and Methods = 3
2.1. mRNA isolation and olive flounder muscle cDNA library construction = 3
2.2. cDNA cloning for the complete coding sequence of P. olivaceus cathepsin K (PoCtK) = 3
2.3. Sequence and phylogenetic analysis = 5
2.4. Expression studies by RT-PCR = 6
2.5. Expression and purification of recombinant mature PoCtK in E. coli = 7
2.6. SDS-PAGE, western blotting and zymography = 9
2.7. Enzyme activity assays = 10
2.8. Effect of enzyme inhibitors, metal ions and detergents = 11
2.9. Extraction of acid-soluble collagen = 12
2.10. Collagenolytic activity and degradation of soluble collagens and ASC = 12
2.11. Preparation of polyclonal antibody against P. oliveaceus cathepsin K = 13
2.12. Enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) = 13
2.13. Western blotting of native and recombinant PoCtK = 14
3. Results = 15
3.1. Cloning and sequence analysis of P. olivaceus cathepsin K cDNA = 15
3.2. Expression studies of PoCtK = 17
3.3. Enzymatic characterization of recombinant maPoCtK = 19
3.4. Degradation of Collagens by maPoCtK in the presence of C-4S = 20
3.5. Production of PoCtK-specific polyclonal antibody = 21
4. Discussion = 22
Abstract = 46
REFERENCES = 47
ACKNOWLEDGEMENTS = 62
- Degree
- Master
-
Appears in Collections:
- 대학원 > 수산생명의학과
- Authorize & License
-
- Files in This Item:
-
Items in Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.