시베리아 철갑상어(Acipenser baerii) gulono-gamma-lactone oxidase (GULO)의 유전자 구조 및 발현특징
- Abstract
- Genomic structure and full-length cDNA of gulonolactone oxidase (GULO), a key enzyme for ascorbic acid biosynthesis were characterized in Siberian sturgeon (Acipenser baerii). Sturgeon GULO gene consists of twelve exons interrupted by 11 introns with the conserved gt/ag rule in the exon-intron boundary regions. Deduced amino acid sequence represents highly conserved motifs in both FAD binding domain and ALO domain. Molecular phylogeny of GULO gene revealed that vertebrate GULO genes formed a monophyletic group and clustered in the pattern which is in accordance with known taxonomic appraisal. Various putative binding sites of transcription factors were predicted on the GULO gene promoter region. They included several stress-response and/or detoxification process such as HSF, CREB, AhR and AP1. In particular, HFH-3 and Gfi-1 were also predicted which have been proposed to serve as the potential transcription factors to regulate kidney-specific gene expression in mouse uromodulin promoter to target production of recombinant proteins into urine of transgenic animals. Tissue distribution of Siberian sturgeon GULO mRNA was kidney-predominant but a weak expression was also detectable in a few tissues. Such minor expression was found in the brain, intestine, liver and muscle. During embryonic development GULO mRNA expression began to appear at the time of rudimentary heart formation and significantly reduced expression was observed after the beginning of exogenous feeding. Potential modulation of GULO gene expression was examined by using RT-PCR in response to heat shock, dietary hormone administration and bacterial challenge. As a result, their possible effects on the modulated transcription of GULO gene toward up-regulation were examined.
- Author(s)
- 김병수
- Issued Date
- 2014
- Awarded Date
- 2014. 2
- Type
- Dissertation
- Publisher
- 부경대학교
- URI
- https://repository.pknu.ac.kr:8443/handle/2021.oak/1556
http://pknu.dcollection.net/jsp/common/DcLoOrgPer.jsp?sItemId=000001966965
- Affiliation
- 대학원
- Department
- 대학원 수산생물학과
- Advisor
- 남윤권
- Table Of Contents
- 목차 ⅰ
표 목차(List of Tables) ⅳ
그림 목차(List of Figures) ⅴ
영문 요약(Abstract) ⅶ
Ⅰ. 서론 1
Ⅱ. 재료 및 방법 5
2.1. 시베리아 철갑상어로부터 GULO 유전자의 cDNA 클로닝 5
2.1.1. NGS 데이타베이스 및 GenBank 염기서열 정보 검색 5
2.1.2. Rapid Ampification of cDNA Ends (RACE) 5
2.2. GULO 유전자의 아미노산 구조 분석 10
2.3. GULO 유전자의 분자계통학적 분석 10
2.4. 시베리아 철갑상어로부터 GULO 유전자의 genomic DNA 클로닝 16
2.4.1. Genbank 염기서열 정보 검색 및 exon-intron 구조 분석 16
2.4.2. 시베리아 철갑상어의 genomic DNA libraries 제작 및 genomic 클로닝 16
2.4.3. 전사조절영역의 생물정보 분석 18
2.5. 시베리아 철갑상어 GULO mRNA의 basal expression 특성 분석 19
2.5.1. 조직 별 발현특성 분석 19
2.5.2. 발생단계 별 발현특성 분석 19
2.6. 자극원 처리에 따른 GULO mRNA 발현의 특성 분석 20
2.6.1. 온도 자극에 따른 GULO mRNA 발현특성 분석 20
2.6.2. 호르몬 경구투여에 따른 GULO mRNA 발현특성 분석. 20
2.6.3. 박테리아 감염자극에 따른 GULO mRNA 발현특성 분석 21
2.7. Total RNA 추출 및 cDNA 합성 22
2.8. RT-PCR 분석 24
Ⅲ. 결과 26
3.1. 시베리아 철갑상어 GULO 유전자의 cDNA 및 아미노산 서열의 특징 26
3.2. GULO 유전자의 분자계통분석 31
3.3. 시베리아 철갑상어 GULO 유전자의 genomic 염기서열 및 exon-intron 구조의 특징 33
3.4. 시베리아 철갑상어 GULO 유전자의 프로모터 염기서열 및 구조적 특징 37
3.5. 시베리아 철갑상어의 조직 별 GULO 유전자의 발현특징 40
3.6. 시베리아 철갑상어의 발생단계 별 GULO 유전자의 발현특징 40
3.7. 온도자극에 따른 시베리아 철갑상어 GULO 유전자의 차등발현특징 42
3.8. 호르몬 사료의 경구투여에 따른 시베리아 철갑상어 GULO 유전자의 차등발현특징 42
3.9. 박테리아 감염자극에 따른 시베리아 철갑상어 GULO 유전자의 차등발현특징 43
Ⅳ. 논의 45
국문 요약 56
Appendix 58
감사의 글 64
참고 문헌 66
- Degree
- Master
-
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