부산 용호만에서 기생성 와편모류 신디니움목의 다양성과 계절적 동태
- Alternative Title
- Genetic diversity and seasonal dynamics of marine parasitic Syndiniales (Alveolata) in Yongho Bay, Busan
- Abstract
- Marine Alveolate groups including the parasitoid Syndiniales, are widely distributed with greate genetic diversity and abundance in the oceans. They infect and potentially control diverse hosts populations including dinoflagellates, ciliates, radiolarians, fish eggs, fish larvae, and crustaceans. By killing or reducing their hosts, Syndiniales may play a key role in maintaining ecosystem diversity. Despite the role, syndinean parasites remain enigmatic, particularly with respect to their temporal dynamics and parasite-host interactions. Here we employed 18S rRNA metabarcoding to analyze the genetic diversity and seasonal dynamics of Syndinales and network analyses were performed to reveal the interactions between syndinean parasites and hosts dynamics. Surface water samples were weekly collected from May 2018 to April 2019. Samples at three different depths (surface, chlorophyll maximum, and bottom layers) were weekly collected from August to October 2019 in Yongho Bay of Busan, Korea. A total of 749,734 sequences and 3,241 OTUs were obtained from seasonal and depth samples. Among them, Syndiniales groups formed 8% in total sequences. In particular, they are genetically diverse, accounting for 17% of total OTUs. The groups exhibited higher relative abundance from October to December (5 to 18%) than other months (0.3% to 11%) and highest relative abundance reads (4~32%) in bottom layer then other depth (0.7~17%). In particular, Syndiniales Group I and II showed higher relative abundance and OTU richness than other Alveolate groups. Co-occurrence and network analyses showed 789 nodes and 311,656 edges. Among them, Syndiniales OTUs accounted for 6% nodes and 32% edges, suggesting that they had a lot of associations with other protist OTUs. Syndiniales Group I had significant positive associations with Spumellarida, Dinophyceae, and Bacillariophyta. Syndiniales Group II had significant positive associations with Spumellarida, Bacillariophyta, MAST and Dinophyceae. The proportions, diversity and interactions of syndiniales sequences in microbial eukaryotes communities indicate that they are the important group as well as play potentially key roles in the microbial food webs in Korean coastal water.
- Author(s)
- 유지애
- Issued Date
- 2021
- Awarded Date
- 2021. 2
- Type
- Dissertation
- Publisher
- 부경대학교
- URI
- https://repository.pknu.ac.kr:8443/handle/2021.oak/2302
http://pknu.dcollection.net/common/orgView/200000374885
- Affiliation
- 부경대학교 대학원
- Department
- 대학원 해양학과
- Advisor
- 김선주
- Table Of Contents
- I. 서론 1
II. 재료 및 방법 3
1. 현장 조사 및 시료 채집 3
2. 물리화학적 요인 분석 및 시각화 6
3. 기생성 와편모류 신디니움목의 군집구조 6
가. DNA추출 6
나. 18S rRNA V3-V4 영역 증폭 및 대량염기서열분석 7
다. 데이터 분석 8
4. 기생성 와편모류 신디니움목의 단일 세포 분석 10
가. 신디니움목의 검경 및 사진 촬영 10
나. DNA 추출, PCR 및 염기서열 분석 10
5. 기생성 와편모류 신디니움목의 계통수분석 11
III. 결과 13
1. 연구해역의 물리 화학적 특성 13
2. 기생성 와편모류 신디니움목의 군집구조와 출현 양상 17
가. 미소진핵생물의 계절별 군집구조와 출현 양상 20
나. 신디니움목의 계절별 군집구조와 출현 양상 24
다. 미소진핵생물의 수심별 군집구조와 출현 양상 29
라. 신디니움목의 수심별 군집구조와 출현 양상 33
3. 기생성 와편모류 신디니움목의 유전적 다양성 38
가. 신디니움목 그룹 I의 유전적 다양성 38
가. 신디니움목 그룹 II의 유전적 다양성 42
4. 기생성 와편모류 신디니움목과 미소진핵생물간의 상호 연관성 46
가. 신디니움목과 미소진핵생물간의 동시출현양상(Co-occurrence) 46
나. 신디니움목과 미소진핵생물간의 네트워크분석 49
IV. 고찰 60
1. 기생성 와편모류 신디니움목의 유전적 다양성과 출현양상 61
2. 기생성 와편모류 신디니움목과 미소진핵생물간의 잠재적 상호작용 64
3. 용호만에서 기생성 와편모류 신디니움목의 생태적 의의과 역할 66
V. 요약 67
VI. 참고문헌 70
VII. 감사의 말 77
- Degree
- Master
-
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