Selection of SNPs related to weight difference in GHR1 and GHR2 of Nile Tilapia (Oreochromis niloticus)

Abstract

나일 틸라피아는 중국과 인도차이나 반도에서 폭 넓게 양식되는 어종이다. 나일 틸라피아의 소비량은 점차적으로 증가하고 있고 그에 따른 경제적인 가치도 증가하고 있는 추세이다. 나일 틸라피아의 Growth hormone receptor1 (OnGHR1)과 growth hormone receptor2 (OnGHR2)는 각각 636개와 574개의 아미노산으로 구성된 막관통 단백질이고, growth hormone을 수용하여 세포와 개체의 성장에 영향을 끼친다. Single nucleotide polymorphisms (SNP)은 각 개체의 표현형에 영향을 끼친다. SNP들은 GHR1, GHR2의 promoter, 5'-UTR, and 3'-UTR에 존재하고 있다. GHR1, GHR2을 증폭하기 위해서 특정 프라이머를 사용하여 PCR을 수행하였다. 이 연구를 통해 OnGHR1에서 15개의 SNP와 OnGHR2에서 7개의 SNP가 발견되었다. 실험에 사용된 각 나일 틸라피아의 무게와 각 SNP들을 조합한 genotypic block (GB)의 상관관계를 분석하였다. 그 후, 나일 틸라피아의 체중 변화에 큰 영향을 끼치는 GB들을 선택하였다. OnGHR1은 GBR1-26와 GBR1-13가 좋은 영향을 끼친다고 분석이 되었으며 OnGHR2는 GBR2-13, GBR2-5좋은 영향을 끼친다고 분석이 되었다. 이렇게 선택된 GB들은 높은 무게를 가질 수 있는 치어 생산을 위한 친어 선별에 사용되어 질 수 있을 것으로 판단이 된다.