Molecular analysis and enzymatic characterization of cathepsin B from olive flounder(Paralichthys olivaceus)
- Abstract
- Papain family중 하나인 cysteine protease는 근골격계 질환 치료를 위한target molecule로 인식 되어 왔으며 Cathepsin B 는 단백질 분해의 초기과정에 관여하는 cysteine proteases 중 하나이다.
본 연구는 넙치의 cathepsin B 유전자의 발현 양상과 넙치 cathepsin B(PoCtB)의 클로닝, 발현 및 효소특성을 분석하였다. cDNA Library Screeningdmf 이용하여 넙치의 cDNA를 클로닝하였다. 넙치의 동정된 cathepsin B 유전자는 1749bp의 open reading frame과 330개의 아미노산으로 이루어져있다. Cathepsin B의 propeptide region 내에 GNFD motif와 Occlucing loop 가 존재함으로써 이것이 명백하게 cathepsin B group이라는 것을 보여주며, 계통 유전학적 분석 결과 다른 종의 cathepsin B에 비해 초창기에 분화되어 나온 것으로 사료된다.
RT-PCR을 수행한 결과 넙치의 모든 조직에서 cathepsin B가 발현되는 것을 볼 수 있었다.
mature enzyme인 maPoCtB은 fusion protein인 glutathione S-transferase를 포함하는 pGEX-4T-1 vector에 삽입하여 E.coli 균주인 DH5α 내에 발현시켰다. 재조합 단백질인 PoCtB을 과발현 시킨 결과 53KDa의 분자량을 가진다. 넙치 cathepsin B 활성은 Z-Arg-Arg-AMC와 같은 fluorogenic 펩타이드 기질을 이용하여 측정되었고 적정 pH는 pH.7.5 이다.
- Author(s)
- 조희성
- Issued Date
- 2013
- Awarded Date
- 2013. 2
- Type
- Dissertation
- Publisher
- 부경대학교
- URI
- https://repository.pknu.ac.kr:8443/handle/2021.oak/24675
http://pknu.dcollection.net/jsp/common/DcLoOrgPer.jsp?sItemId=000001966053
- Alternative Author(s)
- Hee Sung Jo
- Affiliation
- 부경대학교 수산생명의학과 대학원
- Department
- 대학원 수산생명의학과
- Advisor
- 정준기
- Table Of Contents
- 1. Introduction
2. Materials and Methods
2.1. mRNA isolation and olive flounder muscle cDNA library construction
2.2. cDNA cloning for the complete coding sequence of PoCtB
2.3. Sequence and phylogenetic analysis
2.4. Expression studies by RT-PCR
2.5. Expression and purification of recombinant mature PoCtB in E. coli
2.6. SDS-PAGE and western blotting
2.7. Enzyme activity assays
2.8. Effect of enzyme inhibitors, metal ions and detergents
3. Results & Discussion
3.1. Cloning and sequence analysis of P. olivaceus cathepsin B cDNA
3.2. Tissue-typic expression of PoCtB
3.3. Enzymatic characterization of recombinant PoCtB
REFERENCES
ABSTRACT
ACKNOWLEDGEMENT
- Degree
- Master
-
Appears in Collections:
- 대학원 > 수산생명의학과
- Authorize & License
-
- Files in This Item:
-
Items in Repository are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.