PUKYONG

Studies on maternal mRNA provisioning strategy and early immune training potential in Siberian sturgeon (Acipenser baerii)

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Abstract
시베리아 철갑상어(Acipenser baerii)는 고생대로부터 진화한 가장 원시적인 현존 어류 중 하나로, 느린 발생 속도, 고영양성 난자, 미성숙한 면역 기관 등 독특한 생물학적 특성을 지닌다. 이러한 특성은 초기 발생단계에서 생존을 위해 다양한 모계 유래 인자(maternal factors)의 탑재와 선천면역 활성의 조기 구축이 필요함을 시사한다.
본 연구에서는 철갑상어의 초기 발생단계에서 작동하는 방어 메커니즘을 분자생물학적으로 규명하고자 하였다. 첫째, 난모세포의 성숙단계별 RNA-seq 분석을 통해 모계 mRNA의 탑재 시기, 성숙단계에 따른 유전자 발현 변화, 그리고 최종적으로 배란 난자에 축적되는 유전자군을 확인하였다. 그 결과, 세포 주기, 조직 분화, 항산화 반응, 면역 방어에 관련된 유전자들이 난의 성숙에 따라 조절됨을 밝혔으며, 이는 체외수정 및 발생을 겪는 어류에서 진화된 host defense 전략의 일환으로 해석된다. 둘째, 난황 자어(prelarva)를 대상으로 선천면역 반응 및 훈련면역(trained immunity) 유도 가능성을 평가하였다. 병원균 Aeromonas hydrophila 및 화학 자극물(LPS, Poly I:C)을 microinjection 방식으로 주입한 결과, Hamp1, HPX, SOD3 유전자가 농도 및 시간 의존적으로 유도되었다. 특히 A. hydrophila로 사전 훈련된 난황 자어는 화학 자극물로 훈련된 개체에 비해 생존율이 유의하게 높아, 훈련면역의 유도 가능성을 입증하였다. 아울러, pronephros 형성 이후의 배아 단계에서도 훈련면역이 최초로 유도될 수 있음을 확인하였다.
이러한 결과는 철갑상어 초기 발생기에 작동하는 선제적 유전자 보호 체계와 선천면역 기반 방어 전략의 존재를 보여주며, 원시 어류의 면역 발달 전략 및 체계적 host defense system의 진화에 대한 이해를 고도화 시키며, 나아가, 본 연구는 난의 품질 개선, 종묘 생존율 향상, 질병 저항성 증진 등 양식 산업에서의 실용적 응용 가능성에 대한 과학적 근거를 제공할 수 있다
Author(s)
김은정
Issued Date
2025
Awarded Date
2025-08
Type
Dissertation
Keyword
Siberian sturgeon, maternal gene, Immune training
Publisher
국립부경대학교 대학원
URI
https://repository.pknu.ac.kr:8443/handle/2021.oak/34378
http://pknu.dcollection.net/common/orgView/200000905118
Alternative Author(s)
Kim Eun Jeong
Affiliation
국립부경대학교 대학원
Department
대학원 수산생물학과
Advisor
Yoon Kwon Nam
Table Of Contents
General introduction 1
Chapter I. Maternal Provisioning Strategies for Protecting Oocytes and Early Embryos in Siberian Sturgeon 3
1. Introduction 4
2. Materials and Methods 6
2.1. Sample Collection 6
2.2. RNA Extraction and cDNA Synthesis 7
2.3. Next-Generation Sequencing (NGS) 7
2.4. RT-qPCR Validation and Biological Variation of Maternal Provisioning Genes 7
2.5. Temporal Expression Patterns of Maternal Genes During Embryonic Development 8
2.6. Statistics 9
3. Results 14
3.1. NGS Overview and General Expression Profiling in Oocytes 14
3.2. Highly Expressed Maternal Genes and Their Functional Categorization 14
3.3. Temporal Patterns and Differential Expression During Oocyte Maturation 20
3.4. Maternal Provisioning of Immune-, Antioxidant-, and Stress-Related Genes 20
3.5. Validation of Gene Abundance and Biological Variation in Ovulated Oocytes 28
3.6. Stage-Dependent Expression Dynamics of Maternal Genes Across Oocyte Maturation 28
3.7. Overview of Maternal Gene Modulation During Embryogenesis 38
3.8. Expression Dynamics of Cell Cycle and Cytoskeletal Genes 38
3.9. Zygotic Activation Patterns of Organogenesis and Metabolic Genes 39
3.10. Maternal Provisioning and Activation of Host Defense Genes 39
4. Discussion 51
Chapter II. Early Immune Training Potential in Siberian Sturgeon Prelarvae 54
1. Introduction 55
2. Materials and Methods 57
2.1. Acquisition and Sampling of Hatched Prelarvae 57
2.2. Optimization of Microinjection Conditions in Prelarvae 57
2.3. Assessment of Infection Susceptibility and Determination of Lethal and Sublethal Challenge Conditions in Early Prelarvae 58
2.4. Assessment of Transcriptional Innate Immune Responsiveness in Pre-immune Stage Prelarvae 59
2.5. Determination of Trainability and Earliest Induction Window for Trained Immunity in Early Life Stages 59
2.6. RT-qPCR Assay and Statistical Analysis 61
3. Results 62
3.1. Age-Dependent Susceptibility of Prelarvae to Aeromonas hydrophila Exposure 62
3.2. Transcriptional Responsiveness of Early Prelarvae to Immune Stimulation 62
3.3. Trained Immunity-Induced Protection of Early Prelarvae Against Aeromonas hydrophila 65
3.4. Comparative Efficacy of Trained Immunity Induced by A. hydrophila and Non-Living Immune Stimulants 66
3.5. Developmental Window and Duration of Trained Immunity Following Early AH Exposure 69
3.6. Developmental Onset of Trainable Immune Competence in Embryonic Stages 70
4. Discussion 74
General discussion 76
References 79
Acknowledgment 84
Degree
Doctor
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대학원 > 수산생물학과
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  • Authorize공개
  • Embargo2025-08-22
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